🧬 Suite Protéodies
Analyseur de Patterns MIDI & Calculateur de Protéodies
Analyseur de Patterns MIDI & Calculateur de Protéodies
Un outil complet pour explorer les liens structurels entre la musique et les séquences biologiques. Analysez vos fichiers MIDI, comparez des motifs et calculez les fréquences de résonance des acides aminés.
Cet outil est strictement expérimental et éducatif. Il permet d’explorer une hypothèse physique proposée par Joël Sternheimer dans les années 1990, sans valeur thérapeutique démontrée chez l’humain.
Rappel : E-value = significativité statistique, Ident = % identité, Ratio = Total/Max Score (répétition du motif), Cover = couverture de la query
Class. ℹ️
Comprendre la ClassificationLe tri des "Top 5" ne se fait pas uniquement sur la meilleure E-value, mais sur un "Score de Pertinence" : Score = -Math.log10(eValue) * repetitionRatio
L'algorithme cherche un équilibre entre la fiabilité statistique (E-value) et la répétitivité du motif (Ratio). Exemple comparatif :
Candidat A (Ignoré) :
Candidat B (Sélectionné) : Pourquoi une E-value à 0.026 est classée "Bruit" ? Bien que le motif soit très répétitif (ce qui le fait remonter en tête de liste), une E-value > 0.001 est statistiquement faible. Cela signifie qu'il y a 2.6% de chance que ce soit du hasard. C'est typique d'une protéodie : une structure très répétitive mais imparfaite (72% d'identité), que BLAST standard aurait ignorée, mais que cet outil met en avant. |
Date | Fichier MIDI | Rang | Param. | Séquence Notes | Séquence AA | Max Score | Total Score | Ratio | E-value | Per.Ident | Acc Len | Accession | Actions |
|---|
Uploadez un fichier texte BLAST (.txt) pour générer un rapport d’analyse détaillé basé sur l’E-value, les scores, la longueur de la séquence et les familles de protéines identifiées.
| Code AA | Acide Aminé | Masse (g/mol) | 🎵 SYNTHÈSE (Stimulation) | 🛑 INHIBITION | ||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| Fréquence (Hz) | Note | Octave | Note MIDI | Note Anglaise | Fréquence (Hz) | Note | Octave | Note MIDI | Note Anglaise | |||
Collez une séquence d'acides aminés (codes à 1 lettre) ci-dessous. Le calculateur générera automatiquement les notes correspondantes pour la synthèse et l'inhibition dans tous les formats.
Exemple : G A R L I C
Méthode physique réelle utilisée dans les études Genodics / Heliyon 2020
Méthode standard avec approximation MIDI → Fréquence
Joël Sternheimer, physicien et compositeur français, a développé dans les années 1990 une théorie révolutionnaire : chaque acide aminé, lorsqu'il est incorporé dans une protéine, possèderait une fréquence vibratoire caractéristique dans le domaine audible.
Il a calculé ces fréquences à partir de la relation d'équivalence masse-énergie d'Einstein (E=mc²), transposée dans le domaine acoustique par une division par 276 (76 octaves) pour ramener les fréquences théoriques (~ 10²¹ Hz) dans le spectre audible humain (20-20 000 Hz).
L'entreprise française Genodics applique aujourd'hui ce principe en agriculture : diffusion d'ondes sonores spécifiques pour stimuler les défenses naturelles des plantes, réduire les maladies et améliorer la résistance climatique, sans intrants chimiques.
Voici la table complète utilisée dans tous nos tests, basée sur les travaux originaux de Joël Sternheimer et l'implémentation de Genodics :
| Note | Acide Aminé | Code 1 lettre | Masse (g/mol) | Remarques |
|---|---|---|---|---|
| Do (C) | Alanine / Arginine | A / R | 89.09 / 174.20 | Ambiguïté selon octave |
| Do# (C#) | Tyrosine | Y | 181.19 | Univoque |
| Ré (D) | Sérine / Tryptophane | S / W | 105.09 / 204.23 | W pour octaves hautes |
| Ré# (D#) | Phénylalanine | F | 165.19 | Univoque |
| Mi (E) | Glutamine / Méthionine | Q / M | 146.15 / 149.21 | Souvent non codé < Do3 |
| Fa (F) | Proline / Thréonine / Valine | P / T / V | 115.13 / 119.12 / 117.15 | Triple ambiguïté |
| Fa# (F#) | Aspartate / Cystéine | D / C | 133.10 / 121.16 | Souvent C en pratique |
| Sol (G) | Asparagine / Isoleucine / Leucine | N / I / L | 132.12 / 131.17 / 131.17 | Souvent L en pratique |
| La (A) | Glu / Gly / Lys / Met | E / G / K / M | 147.13 / 75.07 / 146.19 / 149.21 | Quadruple ambiguïté, souvent K |
| La# (A#) | Glutamine / Histidine | Q / H | 146.15 / 155.15 | Souvent H |
| Si (B) | Phénylalanine / Sélénocystéine | F / SeC | 165.19 / 168.05 | Souvent F |
Si le code Sternheimer révèle une correspondance réelle entre musique et biologie, alors les mélodies que l'humanité a jugées "belles" (respectant la grammaire tonale) devraient, une fois traduites en peptides, correspondre significativement à des séquences protéiques réelles.
L'E-value mesure la probabilité qu'un alignement soit dû au hasard. Plus elle est petite, plus le match est significatif :
Analyse basée sur le fichier blast_history_2025-12-09.csv.
Résultat BLAST : E-value = 9e-17, 100% Identité.
Identification : Hypothetical protein [Pseudomonadota bacterium].
Classification : ⭐ Exceptionnel (Score 79.5)
Résultat BLAST : E-value = 4e-14, 100% Identité.
Identification : Hypothetical protein [Nitrososphaeraceae archaeon].
Classification : ✨ Très bon (Score 74.4)
Résultat BLAST : E-value = 2e-11, 100% Identité.
Identification : Segregation/condensation protein A [Sorangium sp.].
Classification : ⭐ Exceptionnel (Score 67.7)
Résultat BLAST : E-value = 2e-06, 76% Identité.
Identification : Hypothetical protein [Puccinia triticina].
Classification : ✨ Très bon (Score 54.1)
Ces morceaux n'ont donné aucun résultat significatif :
Certains riffs répètent massivement la même note (ex: C# C# C#...). Cela crée une séquence d'un seul acide aminé (YYYYY...). BLAST adore ces répétitions, mais c'est souvent un faux positif (low-complexity region).
La table Sternheimer ne code pas bien les octaves 1 et 2. Les musiques utilisant beaucoup de basses (Hans Zimmer, Dubstep) génèrent des séquences pleines de trous ("?"), rendant l'analyse impossible.
L'analyse du 09/12/2025 confirme la tendance : les musiques tonales structurées (Mozart, Vivaldi, Aphex Twin mélodique) génèrent des correspondances biologiques extrêmement fortes (E < 10⁻¹⁰), tandis que les séquences atonales ou bruitistes (Death Grips, Jazz expérimental) restent dans le bruit statistique.
Une protéodie est une séquence sonore spécifiquement composée pour correspondre à la séquence d'acides aminés d'une protéine particulière. Cette approche révolutionnaire, développée par le physicien français Joël Sternheimer dans les années 1990, repose sur l'hypothèse que chaque acide aminé possède une fréquence vibratoire caractéristique qui peut être transposée dans le domaine audible.
Lorsqu'une protéine est synthétisée par un ribosome, chaque acide aminé incorporé émet une onde quantique à une fréquence spécifique. Sternheimer a calculé que ces fréquences, ramenées dans le spectre audible, pourraient résonner avec les processus de biosynthèse et ainsi moduler l'expression protéique.
Voir l'onglet "Présentation" pour la table complète.
Le concept de protéodie découle des travaux de Sternheimer en physique théorique sur les ondes d'échelle. Selon cette théorie, lors de la synthèse protéique, chaque incorporation d'acide aminé crée une perturbation quantique qui se propage sous forme d'onde.
Le ribosome, lors de l'élongation peptidique, génère des oscillations conformationnelles dont la fréquence dépend de la masse de l'acide aminé incorporé. Ces oscillations pourraient créer un "champ d'information" autour de la cellule et être modulées par des ondes sonores externes.
En 2001, une étude pilote a été menée au St. Marianna University Hospital (Japon). Cette étude visait à évaluer la non-toxicité des protéodies.
Protéodies : Inh. IL-4 + IL-12A + Inh. C5a
Résultat : Plus aucun médicament contre les migraines depuis le début de l'écoute.
Protéodie : Inh. neuropeptide Y + CILP
Résultat : Rémission complète de la douleur en 2 jours (après 15 mois de souffrance).
Publiée en 2020 dans Heliyon, cette étude est le premier article peer-reviewed validant l'effet des protéodies.
Stimulation DHN-cognate : +35% de poids frais (p < 0.01) sous stress hydrique.
Aucun effet significatif par rapport au silence. Cela prouve que c'est la séquence qui compte, pas juste les fréquences.
Dans les deux études, ce n'est pas la simple exposition au son qui agit, mais la SÉQUENCE ORDONNÉE correspondant à une protéine spécifique.
Si validé, cela offrirait un traitement adjuvant non-invasif, personnalisé et sans effets secondaires chimiques.
Class. ℹ️
Comprendre la ClassificationLe tri des "Top 5" ne se fait pas uniquement sur la meilleure E-value, mais sur un "Score de Pertinence" : Score = -Math.log10(eValue) * repetitionRatio
L'algorithme cherche un équilibre entre la fiabilité statistique (E-value) et la répétitivité du motif (Ratio). Exemple comparatif :
Candidat A (Ignoré) :
Candidat B (Sélectionné) : Pourquoi une E-value à 0.026 est classée "Bruit" ? Bien que le motif soit très répétitif (ce qui le fait remonter en tête de liste), une E-value > 0.001 est statistiquement faible. Cela signifie qu'il y a 2.6% de chance que ce soit du hasard. C'est typique d'une protéodie : une structure très répétitive mais imparfaite (72% d'identité), que BLAST standard aurait ignorée, mais que cet outil met en avant. |
Date | Fichier MIDI | Rang | Param. | Séquence Notes | Séquence AA | Max Score | Total Score | Ratio | E-value | Per.Ident | Acc Len | Accession | Actions |
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Sélectionnez 2 à 5 séquences dans le tableau ci-dessus en cochant les cases.
Ces poids déterminent l'importance de chaque critère dans le calcul du score final (/100).